Sementara itu saingan tedekatnya untuk meraih gelar juara dunia, Jorge Lorenzo (Yamaha Factory Racing) hanya berada di urutan ke empat, kalah dari rekan satu timnya Valentino Rossi yang berada di urutan ke dua dan Cal Crutchlow (Monster Yamaha Tech 3) di urutan ketiga.
Rekan satu tim Marquez, Dani Pedrosa berada di urutan kelima.
Berikut hasil kualifikasi MotoGP Sepang:
Kualifikasi 2
| Pos. | Pebalap | Negara | Motor | Waktu | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Marc MARQUEZ | SPA | Honda | 2'00.011 | ||||
| 2 | Valentino ROSSI | ITA | Yamaha | 2'00.336 | ||||
| 3 | Cal CRUTCHLOW | GBR | Yamaha | 2'00.359 | ||||
| 4 | Jorge LORENZO | SPA | Yamaha | 2'00.578 | ||||
| 5 | Dani PEDROSA | SPA | Honda | 2'00.692 | ||||
| 6 | Alvaro BAUTISTA | SPA | Honda | 2'00.974 | ||||
| 7 | Bradley SMITH | GBR | Yamaha | 2'01.306 | ||||
| 8 | Andrea DOVIZIOSO | ITA | Ducati | 2'01.635 | ||||
| 9 | Aleix ESPARGARO | SPA | ART | 2'02.151 | ||||
| 10 | Andrea IANNONE | ITA | Ducati | 2'02.536 | ||||
| 11 | Nicky HAYDEN | USA | Ducati | 2'02.900 | ||||
| 12 | Stefan BRADL | GER | Honda |
Kualifikasi 1
| Pos. | Pebalap | Negara | Motor | Waktu | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13 | Colin EDWARDS | USA | FTR Kawasaki | 2'02.858 | ||||
| 14 | Claudio CORTI | ITA | FTR Kawasaki | 2'03.175 | ||||
| 15 | Hector BARBERA | SPA | FTR | 2'03.212 | ||||
| 16 | Hiroshi AOYAMA | JPN | FTR | 2'03.418 | ||||
| 17 | Yonny HERNANDEZ | COL | Ducati | 2'03.651 | ||||
| 18 | Randy DE PUNIET | FRA | ART | 2'03.805 | ||||
| 19 | Michael LAVERTY | GBR | ART | 2'04.198 | ||||
| 20 | Danilo PETRUCCI | ITA | Ioda-Suter | 2'04.310 | ||||
| 21 | Luca SCASSA | ITA | ART | 2'05.199 | ||||
| 22 | Bryan STARING | AUS | FTR Honda | 2'06.038 | ||||
| 23 | Lukas PESEK | CZE | Ioda-Suter | 2'06.203 | ||||
| 24 | Damian CUDLIN | AUS | PBM | 2'06.273 |