Kemenangan itu membuat Bayern mengoleksi 18 poin, dan berhak menggeser pemuncak klasemen sebelumnya Borussia Moenchengladbach, yang baru bermain pada Minggu malam.
Freiburg menyusul Bayern untuk naik ke peringkat kedua. Freiburg juga mendulang kemenangan 2-1 atas tamunya RB Leipzig, dan kini telah mengoleksi 17 poin.
Derby Lembah Ruhr edisi kali ini tidak menghasilkan pemenang, ketika Schalke 04 dan Borussia Dortmund sama-sama gagal membobol gawang lawan.
Hertha Berlin kembali harus menelan kekalahan, setelah mereka takluk 2-3 dari tamunya Hoffenheim. Sedangkan Bayer Leverkusen menyelamatkan diri dari kekalahan dan bermain imbang 2-2 dengan tamunya Werder Bremen.
Baca juga: Leverkusen bermain imbang 2-2 dengan Werder Bremen
Baca juga: Muenchen puncaki klasemen setelah kalahkan Berlin
Tim juru kunci Paderborn mendapatkan kemenangan perdananya musim ini, setelah mereka menekuk Fortuna Dusseldorf dengan skor 2-0.
Sabtu (26/10) dini hari
Mainz 05 3 (Jean-Paul Boetius 21', Robin Quaison 57', Levin Oztunali 82') FC Koln 1 (Simon Terodde 14')
Sabtu (26/10) malam
Bayern Munich 2 (Benjamin Pavard 13, Robert Lewandowski 53') Union Berlin 1 (Sebastian Polter PEN 86')
Schalke 04 0 Borussia Dortmund 0
Hertha Berlin 2 (Dodi Lukebakio 55' Salomon Kalou 69') Hoffenheim 3 (Jurgen Locadia 33', Andrej Kramaric 38', Benjamin Hubner 79')
Freiburg 2 (Nicolas Hofler 45', Nils PEtersen 90') RB Leipzig 1 (Lukas Klostermann 90')
Paderborn 2 (Abdelhamid Sabiri 43', Sebastian Schonlau 64') Fortuna Dusseldorf 0
Bayer Leverkusen 2 (Omer Toprak OG 4', Lucas Alario 58') Werder Bremen 2 (Milot Rashica 40', Davy Klaassen 48')
Minggu (27/10) malam
21.30 Wolsburg vs Augsburg
Senin (28/10) malam
00.00 Borussia Moenchengladbach vs Eintracht Frankfurt
Klasemen Liga Jerman